辦理海南醫療機構許可證代辦通常需要經過以下步驟：

1. 選擇代辦機構：首先，您需要選擇一家具有資質和經驗的代辦機構，確保其具有合法經營資質和良好的信譽。您可以通過咨詢其他醫療機構或行業協會，以獲取推薦或參考意見。

2. 協商服務內容：與代辦機構協商具體的服務內容、費用、辦理流程等事項，并簽訂代辦服務合同。確保合同內容明確詳細，并注意了解服務費用和辦理周期等方面的信息。

3. 提供資料：根據代辦機構的要求，向其提供申請醫療機構許可證所需的資料和文件，包括營業執照、法人身份證明、醫療設備購置證明、人員資格證明等相關材料。

4. 代辦流程：代辦機構將按照相關法規和流程，代表您向海南省衛生健康委員會或其他主管部門遞交申請材料，并協助處理整個辦理流程。代辦機構可能會協助您進行現場檢查、規劃設計、安全防護等相關工作。

5. 跟進辦理：在代辦過程中，您可以與代辦機構保持密切聯系，及時了解辦理進展、可能出現的問題以及需要配合的事項。

6. 領取許可證：在辦理完成后，代辦機構將協助您領取海南醫療機構許可證，并將其交付給您。

請注意，選擇代辦機構時需謹慎，確保其合法合規，避免因為代辦機構的違規行為而造成不必要的風險。強烈建議在選擇代辦機構之前，對其資質、信譽和業務能力進行充分的調查和了解。